Arbeitsgruppen und Infrastrukturen
Der Leibniz-WissenschaftsCampus InterACt verbindet die verschiedenen Arbeitsgruppen und Infrastrukturen am Forschungsstandort der Metropolregion Hamburg zum Thema "Integrative Analyse von pathogeninduzierten Kompartimenten". Die am Netzwerk beteiligten Arbeitsgruppen und Infrastrukturen sowie ihre Forschungsbeiträge in InterACt sind nachstehend aufgeführt.
Computational Systems Biology
Prof. Dr. Jan Baumbach
Universität Hamburg, Fachbereich Informatik, ZBH - Zentrum für Bioinformatik
Forschungsinteressen und Expertise
Bioinformatik | Computational Biology | System Medizin | Network Medizin | Biomarker Discovery & Validation | Precision Medizin | Computational Biotechnologie | Big Data Analytics | Machine Learning | Combinatorial Optimization | Privacy by Design
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Strukturbiologie von Infektion und Entzündung, Kristallogenese
Prof. Dr. Christian Betzel
Universität Hamburg, Fachbereich Chemie
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Quantitative Virologie
Prof. Dr. Jens Bernhard Bosse
Medizinische Hochschule Hannover, Institut für Virologie, RESIST Exzellenzcluster| Centre of Structural Systems Biology CSSB | Leibniz-Institut für Virologie, RESIST Gastgruppe
Forschungsinteressen und Expertise
Räumlich-zeitliche Kontrolle der Virusmorphogenese | Dynamik und Kinetik molekularer Maschinen | Live-Cell-Imaging | light-sheet Mikroskopie | Korrelative Kryo-Mikroskopie
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Virus-Wirt-Interaktion
Prof. Dr. Wolfram Brune
Leibniz-Institut für Virologie | Universität Hamburg, Fachbereich Chemie
Forschungsinteressen und Expertise
Virus-Wirt-Interaktion | Herpesvirus | Cytomegalovirus | Replikationskompartimente | Zelltod | Apoptose | Nekroptose | Pyroptose | Autophagie | Makrophage | angeborene Immunität | Signalübertragung | inflammatorische Zytokine | Interferon | ER-Stress | UPR | Zellfusion | Syzytium | Antivirale Substanzen
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Virale Transformation
Prof. Dr. Thomas Dobner
Leibniz-Institut für Virologie | Universität Hamburg, Fachbereich Biologie
Forschungsinteressen und Expertise
virale Onkogenese | intrinsische Immunität | SUMOylierung | Zellkerndomänen | virale Replikationskompartimente | antivirale Targets
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Molekulare und Diagnostische Virologie
Prof. Dr. Nicole Fischer
UNIVERSITätsklinikum Hamburg-Eppendorf, Institut für Medizinische MikROBIOLOGie, Virologie und Hygiene
Forschungsinteressen und Expertise
Virus-Wirt-Interaktionen | Humane Polyomaviren | Virale Onkogenese | Virale Persistenz |Virale Genexpression und Kompartimente | Next Generation Sequencing | Antivirale Inhibitoren (Polyomaviren) | Organoid-Technologie | Genomik | Epigenetik
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Zelluläre Parasitologie
Prof. Dr. Tim Gilberger
Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin | Centre of Structural Systems Biology CSSB | Universität Hamburg, Fachbereich Biologie
Forschungsinteressen und Expertise
Zellbiologie human-pathogener Parasiten | Malaria | Proliferation-Strategien in Erythrozyten | Immunevasion | Pathogenitätsfaktoren | Dynamik intrazellulärere Kompartimente | Proteinnetzwerke | Post-translationale Modifikation | Struktur-Funktionsanalysen | Reverse Genetik | Phenotypisierung | Lebendzell- und hochauflösend-Mikroskopie
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Strukturelle Zellbiologie der Viren
Prof. Dr. Kay Grünewald
Leibniz-Institut für Virologie | Centre of Structural Systems Biology CSSB | Universität Hamburg, Fachbereich Chemie
Forschungsinteressen und Expertise
Strukturelle Zellbiologie | Virus-Wirt-Wechselwirkungen (Herpesviren, Adenoviren, Retroviren) | Protein-Protein-Interaktionsnetzwerke | Integrative Strukturbiologie | Kryo-Elektronenmikroskopie/-tomographie | Korrelative Kryo-Mikroskopie | Bildanalyse und Daten-Prozessierung | Molekulare Dynamik
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Biophysik
Prof. Dr. Thomas Gutsmann
Forschungszentrum Borstel, Leibniz Lungenzentrum
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Forschungsinteressen und Expertise
Virus-Wirts Interaktionen | Hepatitis C Virus | Flaviviren | Lipid droplets | Lipidmetabolismus | Organell-Interaktionen | Lebendzell-Mikroskopie | Elektronenmikroskopie | Endogene Retroelemente
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Molekulare Pflanzenphysiologie
Prof. Dr. Stefan Hoth
Universität Hamburg, Fachbereich Biologie
Forschungsinteressen und Expertise
Molekularbiologie, Biochemie und Zellbiologie von Autoimmunität und Abwehr in Pflanzen | Funktion Plasmamembran-assoziierter Ubiquitinligasen bei der Anbindung von Vesikeln | Die Funktion von Meristemen und Reparaturkontrolle von DNA-Schädigungen
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RNA Biochemie und Molekularbiologie
Prof. Dr. Zoya Ignatova
Universität Hamburg, Fachbereich Chemie
Forschungsinteressen und Expertise
Inhalte folgenTranslation und Proteinfaltung | Kontrollmechanismen der Translation | Systembiologie der Translation | Translation-bedingte Krankheiten und Infektionen | Gewebespezifität der Translation und unterschiedlicher Krankheiten | RNA | Ribosomen | Alterungsprozesse/Aging
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Experimentelle Kryo-Photonik
Prof. Dr. Rainer Kaufmann
Centre for Structural Systems Biology CSSB | Universität Hamburg, Fachbereich Physik
Forschungsinteressen und Expertise
super-auflösende Kryo-Fluoreszenzmikroskopie | cryo-CLEM | super-auflösende CLEM in Harz eingebetteten Schnitten | Photo-Physik unter Kryo-Bedingungen | Optik-Entwicklung | Kryo-Technik und Entwicklung
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Molekulare Pflanzengenetik
Prof. Dr. Julia Kehr
Universität Hamburg, Fachbereich Biologie
Forschungsinteressen und Expertise
Pflanzen| Langstreckentransport| Signalweiterleitung| RNA bindende Proteine| Ribonukleoproteinkomplexe| Virusinfektion| Massenspektrometrie
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Integrative modelling of infection cycles
Dr. Jan Kosinski
Centre of Structural Systems Biology CSSB | EMBL
Forschungsinteressen und Expertise
Infektionszyklen von Pathogenen | Wirt-Pathogen-Interaktionen | Makromolekulare Komplexe | Influenza-A-Virus | Kernporenkomplexe | Proteomik | Bildgebung | Computermodellierung
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Funktionale Proteinfibrillen
Prof. Dr. Meytal Landau
CENTRE OF STRUCTURAL SYSTEMS BIOLOGY CSSB | DEUTSCHES ELEKTRONEN-SYNCHROTRON | UNIVERSITÄTSKLINIKUM HAMBURG-EPPENDORF
Forschungsinteressen und Expertise
Strukturbiologie | Amyloidfibrillen | Protein-Selbstorganisation | Röntgenkristallographie | Kryo-Elektronenmikroskopie | Strukturelle Bioinformatik | Virulente und antimikrobielle Fibrillen | Mikroben und Neurodegeneration | Protein-Membran-Wechselwirkungen
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Evolutionäre Immungenomik
Prof. Dr. Tobias Lenz
Universität Hamburg, Fachbereich Biologie
Forschungsinteressen und Expertise
Evolutionsgenetik und -genomik | Wirt-Pathogen Koevolution | Antigen-Präsentation und -Erkennung | Bioinformatik
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Zelluläre Mikrobiologie
Prof. Dr. Stefan Linder
Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf
Forschungsinteressen und Expertise
Phagozytose und intrazelluläre Prozessierung von Bakterien | Spirochäten (Borrelia burgdorferi) | Primäre humane Makrophagen | Zytoskelett (Aktin, Tubulin) | Intrazellulärer Transport | Membran-Dynamik | Lebendzell- und hochauflösende Mikroskopie
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Pharmazeutische und Medizinische Chemie
Prof. Dr. Wolfgang Maison
Universität Hamburg, Fachbereich Chemie
Forschungsinteressen und Expertise
Organische Synthese und Komplexchemie | Tumor targeting (Prostatakrebs); metallbasierte Reagenzien für MRI, PET und SPECT | Antibakterielle Oberflächen (Metalle und Kunststoffe) für Implantate und die klinische Hygiene | Entwicklung von chemischen Korrosionsinhibitoren | Siderophor-Analoga für biomedizinische Anwendungen
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Organische Chemie, Medizinische Chemie und Chemische Biologie
Prof. Dr. Chris Meier
Universität Hamburg, Fachbereich Chemie
Forschungsinteressen und Expertise
Organische und Medizinische Chemie | Chemische Biologie | Virustatika-Design (Virusfamilien: Bunya-Viren, Retroviren, Hepatitis, Filo-Viren) | Small Molecule-Inhibitoren | Nucleos(t)id-Chemie | Pronucleotide | lipophile second-messengers auf Adenosin-Basis | RNA-Polymerasen | Strukturbiologie bei Polymerasen und dem Enzym DHODH
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Experimentelle Biophysik
Prof. Dr. Arwen Pearson
Universität Hamburg, Fachbereich Physik | Center for Ultrafast Imaging CUI | Center for Free-electron Science CFEL
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Algorithmisches Molekulares Design
Prof. Dr. Matthias Rarey
Universität Hamburg, Fachbereich Informatik, ZBH - Zentrum für Bioinformatik
Forschungsinteressen und Expertise
Chemieinformatik | Strukturbasiertes Molekulares Design | Struktur-Bioinformatik | Entwicklung computergestützter Methoden für die Lebenswissenschaften | Visuelle Analytik chemischer Daten | Machinelles Lernen und Daten-Mining auf chemischen Strukturen und Molekülkomplexen | Navigation in großen chemischen Räumen
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Technologieplattform Mikroskopie und Bildanalyse
Dr. Rudolph Reimer
Leibniz-Institut für Virologie
Forschungsinteressen und Expertise
Konfokale Mikroskopie | TIRF | Bildgebende Einzelmolekültechniken | Funktionelle Bildgebung lebender Zellen | 3D-Elektronenmikroskopie | TEM / REM | Korrelative Licht- und Elektronenmikroskopie | (Kryo)-Ultramikrotomie | Mikrotomie | Kryo-Präparation | Histologie | Negative Färbung von Partikeln | Bildanalyse
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Pflanzenbiochemie und Infektionsbiologie
Prof. Dr. Sigrun Reumann
Universität Hamburg, Fachbereich Biologie
Forschungsinteressen und Expertise
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Strukturelle Virologie
Dr. Maria Rosenthal
Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin
Forschungsinteressen und Expertise
Bunyaviren | Lassa-Virus | Rift-Valley-Fiebervirus | Genomreplikation und -transkription | molekulare Mechanismen | L-Protein | virale Polymerase | Protein-Protein-Interaktion | Protein-RNA-Interaktion | Virus-Wirts-Interaktion | funktionelle Assays | Strukturbiologie | Biochemie | Molekularbiologie | reverse Genetik
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Systembiologie der Arboviren
Pietro Scatuuro
Leibniz-Institut für Virologie
Forschungsinteressen und Expertise
Arboviren | RNA-Viren | Flaviviren | Bottom-up-Massenspektrometrie | Virusreplikation| Zelluläre Determinanten der Replikation von Plus-Strang-RNA-Viren| Systembiologie| Proteomik| posttranslationale Modifikationen| Moskito-Zell-Virus-Interaktionen
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Zelluläre Mikrobiologie
Prof. Dr. Ulrich Schaible
Forschungszentrum Borstel, Leibniz Lungenzentrum
Forschungsinteressen und Expertise
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Forschungsinteressen und Expertise
Analyse und Modellierung von Transportprozesse von Krankheitserregern in biologischen Systemen | Algorithmen & Multiskalenanalyse für komplexe Mikroskopiedaten (z. B. Live-Cell Imaging) | Maschinelles Lernen zur Analyse von Mikroskopiebildern | Training und Programmentwicklung für die Bilddatenanalyse
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Massenspektrometrische Proteom-Analytik
Prof. Dr. Hartmut Schlüter
Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf | Universität Hamburg, Fachbereich Chemie
Forschungsinteressen und Expertise
differentielle quantitative Massenspektrometrie-basierte Proteomik | markierungsbasierte Quantifizierung: SILAC, TMT | markierungsfreie Quantifizierung: DIA, DDA, SRM | Systembiologie | Protein-Protein-Wechselwirkungen | Stoffwechsel-/Signal-Weg-Analyse | gezielte Proteomik | massenspektrometrische Bildgebung | Proteoformen | Glykane | Glykoproteomik | Phosphoproteomik
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Entwicklungsbiologie
Prof. Dr. Arp Schnittger
Universität Hamburg, Fachbereich Biologie
Forschungsinteressen und Expertise
Eintritt und Progression durch Meiose | Organisation meiotischer Chromosomen | Zellbiologie der Meiozyten | DNA-Schädigungsreaktion und homologe Rekombination | Bildgebung lebender Zellen
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Multi-User Cryo-EM facility
Dr. Carolin Seuring
CENTRE OF STRUCTURAL SYSTEMS BIOLOGY CSSB | Universität Hamburg
Forschungsinteressen und Expertise
Kryo-Elektronenmikroskopie | Wirt-Pathogen-Interaktion | Molekulare und zelluläre Elektronen-Kryo-Tomographie | Cryo-SPA | FIB / SEM | Korrelative Licht- und Elektronenmikroskopie | Kryo-Probenpräparation | Negativfärbung von Partikeln | Bildanalyse | Ausbildung | Methodenentwicklung
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Molekulare und Strukturelle Mikrobiologie
Prof. Dr. Holger Sondermann
CENTRE OF STRUCTURAL SYSTEMS BIOLOGY CSSB | DEUTSCHES ELEKTRONEN-SYNCHROTRON | CHRISTIAN-ALBRECHTS-UNIVERSITÄT, KIEL
Forschungsinteressen und Expertise
Strukturbiologie | Bakterien, Bakterielle Biofilme | Zelluläre Signaltransduktion | Proteinchemie und -biophysik | Struktur-Funktion-Analyse
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AG Spielmann
Dr. Tobias Spielmann
BERNHARD-NOCHT-INSTITUT FÜR TROPENMEDIZIN
Mikrobiologie und Biotechnologie
Prof. Dr. Wolgang Streit
Universität Hamburg, Fachbereich Biologie
Forschungsinteressen und Expertise
Funktionelle Metagenomik zur Suche nach neuen Biokatalysatoren | Mikrobieller Abbau von Plastik | Marine Biotechnologie | Mikrobielle Biofilme: Analytik, Architektur und Omics | Zell-Zell-Kommunikation bei Bakterien
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Technologieplattform Mikroskopie und Bildanalyse
Dr. Roland Thünauer
Leibniz-Institut für Virologie
Forschungsinteressen und Expertise
Konfokale Mikroskopie | TIRF | Bildgebende Einzelmolekültechniken | Funktionelle Bildgebung lebender Zellen | 3D-Elektronenmikroskopie | TEM / REM | Korrelative Licht- und Elektronenmikroskopie | (Kryo)-Ultramikrotomie | Mikrotomie | Kryo-Präparation | Histologie | Negative Färbung von Partikeln | Bildanalyse
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Integrative Virologie
Prof. Dr. Maya Topf
CENTRE OF STRUCTURAL SYSTEMS BIOLOGY CSSB | Leibniz-Institut für Virologie | Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf
Forschungsinteressen und Expertise
Computergestützte Strukturbiologie | makromolekulare Aggregate | Interaktionsnetzwerke viraler Proteine | Kryo-Elektronenmikroskopie | Validierung in der Kryo-Elektronenmikroskopie | Bildverarbeitung | Dichteanpassung | Molekulare Simulationen | Molekulares Docking
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Mathematics and Computational Virology
Prof. Dr. Reidun Twarock
University of York
Forschungsinteressen und Expertise
Mathematische Modelle und Computermodellierung von Virus Strukturen, Viren Assemblierung und viraler Evolution | Intra- und interzelluläre Infektionsmodelle | Bioinformatik von viralen Genomen | antivirale Therapie | Virus Nanotechnologie
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Dynamik viraler Strukturen
Dr. Charlotte Uetrecht
Centre of Structural Systems Biology CSSB | European XFEL GmbH | Leibniz-Institut für Virologie | Universität Siegen
Forschungsinteressen und Expertise
Virale Kapsidassemblierung sowie virale Replikationskomplexe und zugrundeliegende Dynamiken der Proteinstruktur | Entwicklung nativer Massenspektrometrie für hochaufgelöste Strukturproteomik und Einzelmolekülabbildung an Röntgen-Freie-Elektronen-Lasern | Wasserstoff/Deuteriumaustausch-Massenspektrometrie
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Zellbiologie der RNA-Viren
Dr. Gabrielle Vieyres
Leibniz-Institut für Virologie
Forschungsinteressen und Expertise
RNA-Viren | Hepatitis-C-Virus | Lipidtröpfchen | Virusreplikation | Morphogenese und Freisetzung | Zelluläre Determinanten der plussträndiger RNA-Virusreplikation | Angeborene Immunität | Zellbiologie | Konfokalmikroskopie | Automatisierte Bildanalyse
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Protein-Produktions-Core Facility
Dr. Susanne Witt
CENTRE OF STRUCTURAL SYSTEMS BIOLOGY CSSB | UNIVERSITÄTSKLINIKUM HAMBURG-EPPENDORF
Forschungsinteressen und Expertise
Klonierung und Mutagenese | R2/S2 Anzucht von Pro- und Eukaryoten | Transformation von Prokaryoten | Transfektion von Eukaryoten | Rekombinantes Hochdurchsatz-Expressionscreening im Plattenformat | Rekombinante Expression in E.coli, Insektenzellen und Säugerzellen | Zellernte und Zelllyse | Ultrazentrifugation und Isolation von Zellmembranen | Reinigung von Proteinen | Entwicklung, Optimierung & Automatisierung von Proteinreinigungsprotokollen | Biophysikalische & Biochemiche Charakterisierung | E. coli Stammsammlung | Sammlung von Expressionsvektoren | NEB freezer
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Infektionsbiologie
N.N.
Universität Hamburg, Fachbereich Biologie
Forschungsinteressen und Expertise
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